Il Consorzio di Bonifica 11 Messina viene istituito con Decreto del Presidente della Regione Siciliana il 23 maggio 1997. Contestualmente, con lo stesso decreto, il n. 147, vengono soppressi, in ambito provinciale, il Consorzio di bonifica “del Mela”, con sede a Messina, il Consorzio del “Versante Tirrenico dei monti Nebrodi” e quello della “Valle Alcantara” che avevano la sede principale nei comuni di Mistretta, sul versante tirrenico della provincia e a Francavilla di Sicilia sul lato jonico del Messinese. Sedi che per esigenze di servizio rimangono per assolvere alle funzioni istituzionali dell’Ente che opera su un territorio, quale quello della provincia di Messina, abbastanza vasto.
Dall’11/06/2009 con Decreto n. 516 dell’Assessore Regionale Agricoltura e Foreste ad interim il Dirigente Generale pro-tempore del Dipartimento Interventi Infrastrutturali dell’Assessorato Agricoltura e Foreste è stato nominato Commissario Straordinario dei Consorzi di Bonifica della Sicilia, ed è stata altresì prevista la nomina di un Vice Commissario per ciascun Consorzio;
In data 19/01/2010 con Decreto n. 300059 del Presidente della Regione Siciliana, in esecuzione della deliberazione della Giunta Regionale n. 587 del 29/12/2009, è stato conferito l’incarico di Dirigente Generale del Dipartimento Interventi Infrastrutturali per l’Agricoltura dell’Assessorato Regionale delle Risorse Agricole ed Alimentari al Prof. Salvatore Barbagallo.
Successivamente, con Decreto n. 51 del 9/08/2010 dell’Assessorato Regionale delle Risorse Agricole ed Alimentari, è stato rinnovato l’incarico al Vice Commissario Straordinario del Consorzio di Bonifica 11 Messina, Dott. Alessandro Lazzara.
Con D.A. n. 1 del 12/12/2012 dell’Assessorato Regionale delle Risorse Agricole ed Alimentari viene istituito l’Ufficio del Commissario Straordinario Unico per tutti i consorzi di bonifica della Sicilia che opera alle dirette dipendenze dell’Assessore Regionale delle Risorse Agricole ed Alimentari. Con tale decreto, altresì, viene nominato, a capo del predetto Ufficio, il Dott. Giuseppe Dimino, quale Commissario Straordinario Unico per tutti i consorzi di bonifica della Sicilia.
Di recente, con D.A. n. 59/2014 del 26/06/2014, a seguito di dimissioni da parte del dott. Dimino, è stato nominato il dott. Francesco Petralia quale Commissario Straordinario del Consorzio di Bonifica 11 Messina, afferente, assieme ai Consorzi di Bonifica 6 Enna, 7 Caltagirone, 8 Ragusa, 9 Catania, 10 Siracusa, al nuovo Consorzio di Bonifica Sicilia Orientale istituito dall’art. 13, c. 2, della L.R. n. 5/2014.
In data 25.02.2015 è stato notificato all’Ente il D.A. n. 10 del 16.02.2015, con il quale a seguito delle dimissione del precedente Commissario, per garantire la continuità dell’azione amministrativa nelle more della ricostituzione degli organi ordinari viene nominato il Funzionario Direttivo Calogero Paolo Mascellino Commissario Straordinario del Consorzio di Bonifica 11 Messina, afferente, assieme ai Consorzi di Bonifica 6 Enna, 7 Caltagirone, 8 Ragusa, 9 Catania, 10 Siracusa, al nuovo Consorzio di Bonifica Sicilia Orientale istituito dall’art. 13, c. 2, della L.R. n. 5/2014. Con D.A. n. 44/GAB del 03/08/2015, a seguito di dimissioni da parte del Funzionario Direttivo Calogero Paolo Mascellino , è stato nominato il dott. Fabrizio Viola quale Commissario Straordinario del Consorzio di Bonifica 11 Messina, afferente, assieme ai Consorzi di Bonifica 6 Enna, 7 Caltagirone, 8 Ragusa, 9 Catania, 10 Siracusa, al nuovo Consorzio di Bonifica Sicilia Orientale istituito dall’art. 13, c. 2, della L.R. n. 5/2014.
In data 22.03.2016, è stato notificato all’Ente il D.A. n. 13/Gab del 16.03.2016 con il quale, a seguito delle dimissione del precedente Commissario Dott. Fabrizio Viola, e vista la necessità di proseguire con la gestione commissariale al fine di garantire senza soluzione di continuità il funzionamento del Consorzio di Bonifica Sicilia Orientale, è stato affidato l’incarico di Commissario Straordinario all’Ing. Giuseppe Maria Margiotta, con il compito di assicurare il regolare funzionamento del predetto Consorzio di Bonifica Sicilia Orientale istituito con L.R. n. 5/2014 art. 13, comma 2, comprendente oltre al Consorzio di Bonifica 11 Messina, i Consorzi di Bonifica 6 Enna, 7 Caltagirone, 8 Ragusa, 9 Catania, 10 Siracusa.